Ахат Мустафин был освобожден от должности ректора БашГУ приказом Министерства образования и науки РФ. Ректор БашГУ Ахат Мустафин освобожден от занимаемой должности в соответствии с приказом Минобразования и науки РФ. На этом посту он был с 25 марта 2010 года.

В официальном приказе федерального ведомства сказано, что от обязанностей ректора освободили из-за того, что уполномоченным собственником было принято решение о прекращении трудового договора. Бывшему ректору должны выплатить денежную компенсацию, которая будет равняться трехкратному среднему месячному заработку.

На данный момент обязанности ректора исполняет Николай Морозкин — проректор по учебной работе. Он будет работать в этой должности до тех пор, пока не утвердят нового ректора в установленном порядке.